Het genetische Testen voor Primaire Immunodeficiency Wanorde

WAAROM IS HET BELANGRIJK OM EEN MOLECULAIRE DIAGNOSE IN PRIMAIRE IMMUNODEFICIENCY WANORDE TE VESTIGEN?
A: Deze informatie staat Gezondheidszorgverleners toe om beïnvloede individuen en families over prognose en optimale toezichtstrategieën beter te informeren, en kan therapie ook leiden. Bijvoorbeeld, zouden de patiënten met strenge gecombineerde immunodeficiency gelijkaardige fenotypes kunnen hebben alhoewel zij varianten in verschillende genen hebben. Het weten van welk gen wordt beïnvloed helpt bepalen of de beste behandelingsoptie de therapie van de enzymvervanging, gentherapie, of een transplantatie van de stamcel zou kunnen zijn.
Bovendien zodra de moleculaire diagnose wordt gevestigd, kunnen de Gezondheidszorgverleners het risico van herhaling beter bepalen en beslissen of onaangetaste familieleden voor dragerstatus, om een geschikte donor van de stamcel te identificeren, of voor andere doeleinden te onderzoeken.
HOE DE KENMERKENDE BENADERING VAN IMMUNODEFICIENCY WANORDE DE LAATSTE JAREN IS VERANDERD?
Historisch, toen een patiënt met een klinische geschiedenis verdacht voor primaire immunodeficiency voorstelde, het kenmerkende proces met een fundamentele immunologische evaluatie en verdere functionele studies begon om het specifieke immunologische tekort te identificeren. Dan, na het versmallen van de differentiële diagnose of het maken van een klinische diagnose, zouden de laboratoria genetische studies kunnen uitgevoerd hebben, als beschikbaar, om een moleculaire diagnose te vestigen.
Nochtans, kan de klinische en genetische ongelijksoortigheid van sommige primaire immunodeficiency wanorde deze benadering uitdaging maken. Het phenotypic spectrum is vrij breed voor sommige wanorde, die in hetzelfde moleculaire tekort resulteren die vrij verschillend onder individuen voorstellen. Bovendien gezien de zeldzame aard van sommige van deze wanorde, zou een patiënt met een fenotype kunnen voorstellen dat nog niet volledig wordt gekenmerkt. Deze scenario's kunnen het moeilijk maken om voor zeer waarschijnlijk het rangschikken van het gen te selecteren om ziekte te veroorzaken. Als de veelvoudige individuele genen van een laboratoriumopeenvolgingen afzonderlijk, het testen ook gekost verbiedend kunnen zijn wanneer immunologische work-up niet de diagnose aan één of een paar genen versmalt.
Met vooruitgang in technologie, het genetische is testen drastisch in kosten verminderd en wijder - beschikbaar geworden. In het bijzonder, hebben de introductie van massaal parallel of de volgende-generatie die (NGS) rangschikken laboratoria een economisch uitvoerbare manier gegeven om vele genen te testen gelijktijdig, die met traditionele Sanger rangschikkend benaderingen tegenover elkaar stelt die slechts één of een paar genen tegelijkertijd typisch testen. Deze vooruitgang, nu beschikbaar in klinische montages, heeft geleid tot een afwisselende „genotype-eerste“ benadering van de diagnose van immunodeficiency wanorde. Bovendien, het wijdverspreide genetische heeft testen in een escalatie in de identificatie van monogenic immunodeficiency wanorde geresulteerd.
WELKE NGS-TESTbenadering HET MEEST AANGEWEZEN VOOR IMMUNODEFICIENCY RANGSCHIKKEN EEN WANORDE-GERICHTE COMMISSIE OF EEN EXOME?
Er zijn pros - en - cons. aan beide benaderingen. De gerichte panelen testen curated deskundig lijst van genen verbonden aan de ziekte van belang en kunnen varianten in exons en bekende die varianten omvatten in niet-codeert gebieden worden gevestigd. Deze panelen kunnen bijkomende methodes voor genen ook impliceren moeilijk om door NGS te testen. Nochtans, is het uitdagend want de laboratoria om gerichte die panelen als extra genen worden bijgewerkt te houden aan ziekte verbonden worden. Exome die rangschikken, die duurder neigt te zijn en een langere keerpunttijd te hebben, belangrijke niet-codeert varianten of zeer belangrijke genen kunnen zou niet omvatten die niet ontvankelijk voor NGS zijn. Nochtans, exome staat rangschikken voor de ontdekking van extra ziekte-geassocieerde genen toe en zou voor individuen met een niet-specifiek fenotype geschikter kunnen zijn dat veelvoudige gerichte panelen anders zou kunnen vereisen.
ZIJN ER BEPERKINGEN AAN GENETISCHE DIAGNOSE?
Ondanks vooruitgang in het testen, kunnen de laboratoria nog geen genetische diagnose voor alle patiënten bereiken. Dit kan aan een gen toe te schrijven zijn dat nog niet met ziekte, oligogenic of polygenic overerving, epigenetics, of andere variabelen is geassocieerd. De Gezondheidszorgverleners zouden daarom moeten blijven genetische informatie met klinische geschiedenis en functionele studies integreren wanneer het maken van een diagnose. Dit vereist dichte samenwerking tussen werkers uit de gezondheidszorg en laboratoriumberoeps.